碧云天生产的T4 RNA Ligase 1,即T4 RNA连接酶1,是一种ATP-依赖的可以催化单链RNA、单链DNA或单核苷酸分子间或分子内5'-P末端与3'-OH末端之间形成磷酸二酯键的酶。T4 RNA Ligase 1对于RNA之间的连接效率最高,DNA与RNA之间的连接效率次之,而DNA之间的连接效率最低,因此也被认为是一种ssRNA ligase。
T4 RNA Ligase 1主要用于RNA和RNA之间的连接,连接时需要5'磷酸基团和3'羟基的存在。
T4 RNA Ligase 1也可以用于RNA和单核苷酸之间的连接,单核苷酸必须为5'和3'均磷酸化的形式,此时常用于RNA的3'末端标记。
T4 RNA Ligase 1也可以用于DNA和RNA之间的连接。当DNA提供5'磷酸基团,RNA提供3'羟基时,连接效率较高;当DNA提供3'羟基,RNA提供5'磷酸基团时,连接效率非常低。
T4 RNA Ligase也可以用于DNA和DNA之间的连接,但连接效率非常低。主要用于DNA的环化连接,例如5' RACE中的cDNA环化。DNA和DNA之间的连接尽管可以进行,但比较困难。
T4 RNA Ligase 1催化连接反应过程如下。首先,T4 RNA Ligase 1与ATP发生反应,产生中间产物T4 RNA Ligase 1-AMP,并释放焦磷酸;接着,AMP从中间产物T4 RNA Ligase 1-AMP中转移至核酸的5'磷酸末端,形成腺苷酰化核酸中间产物;最后,在T4 RNA Ligase 1的催化下,另一核酸的3'羟基进攻腺苷酰化核酸中间产物的5'磷酸末端,形成3'-5'磷酸二酯键,并释放出AMP。
用途:ssRNA的分子间连接;ssRNA与ssDNA的分子间连接;也可以用于ssDNA分之间连接,但效率较低;ssRNA 3′-OH末端用放射性同位素5'-[32P]pCp等的标记;单链Oligo RNA及Oligo DNA的合成;tRNA的特别修饰;在5'-RACE (Rapid Amplification of cDNA Ends)实验中,用于寡核苷酸连接到单链cDNA中;在蛋白质中引入非天然氨基酸等。
来源:大肠杆菌表达的重组蛋白,表达基因的来源为T4嗜菌体,该酶分子量约为44kDa。
活性定义:One unit is defined as the amount of enzyme required to convert 1 nanomole of 5´-[32P]rA16 into a phosphatase-resistant form in 30 minutes at 37℃。
纯度:不含DNA内切酶和外切酶,不含RNA酶,不含磷酸酯酶。
酶储存溶液:10mM Tris (pH7.5), 200mM NaCl, 0.1mM EDTA, 1mM DTT, 50%(v/v) Glycerol。
10X Reaction Buffer:500 mM Tris-HCl (pH 8.0 at 25℃), 100 mM MgCl2, 20 mM DTT。
失活或抑制:65℃加热15min或煮沸2min可使T4 RNA Ligase 1失活。或加入10%体积的0.5M EDTA pH8.0也可以终止反应。
包装清单:产品编号 | 产品名称 | 包装 |
R0621S-1 | T4 RNA Ligase 1 (10U/µl) | 100µl |
R0621S-2 | 10X Reaction Buffer | 300µl |
R0621S-3 | ATP (10mM) | 200µl |
R0621S-4 | PEG8000 (50%, RNase free) | 500µl |
— | 说明书 | 1份 |
产品编号 | 产品名称 | 包装 |
R0621M-1 | T4 RNA Ligase 1 (10U/µl) | 500µl |
R0621M-2 | 10X Reaction Buffer | 1.5ml |
R0621M-3 | ATP (10mM) | 1ml |
R0621M-4 | PEG8000 (50%, RNase free) | 1.5ml×2 |
— | 说明书 | 1份 |
-20℃保存,至少一年有效。
注意事项:本产品连接的底物无论是单链RNA还是单链DNA,都需要确保5'末端磷酸化或腺苷酰化,同时3'末端是羟基。
如果连接底物为双链RNA或DNA,推荐使用碧云天生产的R0632 T4 RNA Ligase 2等系列产品。
可根据具体应用选择合适的操作方法,可能需准备额外的试剂,如RNase inhibitor、DEPC水等。
根据连接反应的类型,推荐在反应体系中加入适量的PEG8000。建议连接单链RNA或DNA的分之间连接反应体系中PEG8000的终浓度为15%-25%,这样可以显著提高酶活性,同时不影响反应特性。
本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。
为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
Reagent | Volume | Final Concentration |
DEPC-treated Water | 15.5µl | - |
ssRNA (20µM) | 0.5µl | 0.5µM |
10X T4 Rnl1 Reaction Buffer | 2µl | 1X |
ATP (1mM) | 1µl | 50µM |
T4 RNA Ligase 1 (10U/µl) | 1µl | 0.5U/µl |
Total Volume | 20µl | - |
Reagent | Volume | Final Concentration |
DEPC-treated Water | 7.5µl | - |
ssRNA (20µM) | 0.5µl | 0.5µM |
10X T4 Rnl1 Reaction Buffer | 2µl | 1X |
ATP (10mM) | 1µl | 0.5mM |
PEG8000 (50%) | 8µl | 0.2 |
T4 RNA Ligase 1 (10U/µl) | 1µl | 0.5U/µl |
Total Volume | 20µl | - |